Федеральная таможенная служба обеспечивает защиту прав интеллектуальной собственности (ИС), к которым относят как товарные знаки и приравненные к ним знаки обслуживания, так и наименования мест происхождения товаров, объектов авторских и смежных прав. Функции таможенных органов по защите прав ИС определены положениями гл. 38 Таможенного кодекса Российской Федерации.

Для эффективной защиты прав ИС и обнаружения незаконного их использования при пересечении таможенной границы Евразийского экономического союза Федеральная служба ведет Таможенный реестр объектов ИС.

При попытке пересечения контрафактными товарами таможенной границы и обнаружении доказательств, что право ИС нарушено, выпуск товаров в свободное обращение приостанавливается. Эффективность защиты прав ИС высоко возрастает при тесном взаимодействии таможенных органов и Правообладателей, которые включили свои товарные знаки (бренды) в таможенный реестр.

 Для включения объектов ИС в ТРОИС Правообладатель должен написать заявление, оплатить взнос и собрать пакет документов. Срок включения объектов ИС в ТРОИС составляет до двух лет и может быть продлен неограниченное количество раз.